亲子鉴定STR**座的命名，DNA链的选择及核心重复单位的确定

作者：安康亲子鉴定机构

2020-04-10 14:22:13

来源：http://www.akbchina.cn 作者：安康亲子鉴定机构

**座的命名有以下两种方式：按照 Genome Database （GDB）命名原则，以**座所在染色体以及首次进入公共数据库的原始序为依据进行命名，记录为D#S##,其中字母D表示DNA, S代表单拷贝序列，D与S之间的数字代表所在的染色体序，s之后的数字表示该染色体上发现并进入公共数据库的序。该命名方式主要适用于非编码区中的STR**座或染色体定位不明的STR**座。例如，D3S1359是指位于人类3染色体上入库数据中第13序列。

按照 STR序列的GenBank注册命名。该命名方式主要适用于位于蛋白编码**及其内含子和假**的STR**座。例如，人类a-纤维蛋白原**第3内含子中的STR序列命名为FGA.

DNA链的选择及核心重复单位的确定

鉴定师学常见STR**座的基序结构参见附录A.DNA链的选择及核心重复单位的确定原则如下：

a）以D#命名的**座，针对***一个进入公共数据库的文献报道的原始序列确定重复单位构成；

b）蛋白编码区域（包括内含子）的STR**座选用编码链确定重复单位；

c）未在附录A提供的STR**座的重复单位序列确定宜采用人类参考序列Hg 19或GRCh38进行序列比对，且采用正向链进行比对；

d）重复序列应从离5'端更近的一个核苷酸开始定义：

e）已建立的与上述原则不一致的重复单位序列仍予以保留。

基于长度多态性检测结果的命名

按照重复单位的重复次数进行命名。例如，**座D13S317的某等位**重复单位的重复次数与同步电泳的Ladder比对后为12,则该等位**命名为12.

对于微变异等位**，其命名是在完整重复单位的重复次数后用一小数点分隔，然后再记录不完整重复单位的碱基数。

对于"ff-ladder" （OL）等位**，可通过参照内标计算每个带有实际分子量标的信峰的位置来进行命名。例如，样本在D6S1043**座的***个信峰是显示为OL等位**，落入bin 12~13, 第二个信峰是等位**14.计算方法可参见图1,其中，样本的等位**14与Ladder的等位**14的大小差值是0.12 nt, OL等位**与等位**13的差值是1.13 nt,则OL等位**峰相对偏移为1.01nt,可判断OL等位**比等位**13少-一个核苷酸，属于微变异等位**，应命名为12.3.

标签： ,亲子鉴定，STR基因座亲子鉴定，DNA核心,

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用户评论

黄先生 / ceo
3分钟前
一直担心孩子是不是在医院报错了，感觉孩子和我长得不像，在安康生物亲子鉴定中心做了DNA亲子鉴定，终于解开了心中的疑惑，非常感谢！
唐女士 / 微商
11分钟前
老公一直怀疑孩子是不是他亲生的，这件事儿我耿耿于怀很久了，终于鼓起勇气来安康生物亲子鉴定中心做了无创胎儿亲子鉴定，选择的匿名委托，客户的保密工作做的不错~
林先生 / 投资
18分钟前
终于拿到DNA亲子鉴定报告，顺利的解决了孩子的上学难题。非常感谢安康生物亲子鉴定中心的工作任务，服务非常周到，主要是报告也得到了政府部门的认可顺利解决问题~~
宝娜杰
26分钟前
一个人带女儿来安康生物亲子鉴定中心做的DNA亲子鉴定，他们这儿的工作人员保密工作做得非常好，总体感觉非常不错~
撒哈拉
45分钟前
在网上查询了很多家DNA亲子鉴定机构的价格，普遍都是好几千元，安康生物亲子鉴定中心这家机构的价格相对便宜些，而且安康生物亲子鉴定中心非常正规。确认了孩子是老公的之后我就可以安心养胎了。
蓝色优郁
59分钟前
安康生物亲子鉴定中心服务非常周到，办事效率也是很高的，为了给孩子办理相关证件，我咨询了是多家亲子鉴定机构，这家资质正规，靠谱！

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